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学术报告六十六 :基于深度学习和同源模板的蛋白质结构预测:

时间:2021-07-19 16:17

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数学与统计学院学术报告[2021] 066

(高水平大学建设系列报告566)

报告题目:  基于深度学习和同源模板的蛋白质结构预测

报告人:杨建益  教授(山东大学

报告时间:20210721日(2:30-4:00 pm

报告地点: 腾讯会议664446105

报告内容:我们在2020年初发表了蛋白质结构预测方法trRosetta,并得到了广泛应用。本报告中,我将介绍我们最近对trRosetta的改进工作,主要包括两方面:把残差网络ResNet替换成为一种多尺度残差网络Res2Net;自动把同源模板加入网络,以进一步提升预测结构的精度。改进后的trRosetta服务器和源代码均可在此获取:https://yanglab.nankai.edu.cn/trRosetta/

报告人简历:杨建益,2011年博士毕业于新加坡南洋理工大学,2011-2014在密歇根大学Yang Zhang实验室从事博士后研究工作,2015-2021先后任南开大学副教授、教授,2018-2019David Baker实验室访问一年,20217月加入山东大学数学与交叉科学研究中心。通过与Yang ZhangDavid Baker等学者的合作,成功开发了I-TASSERtrRosetta等著名结构预测算法,在Nature MethodsPNAS等期刊发表SCI论文40多篇,被SCI他引5000多次,5篇论文入选ESI高被引论文。

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                          数学与统计学院

 

                                           20210719