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学术报告四十九:人工智能超级计算精准药物发现:抗衰老与新冠

时间:2021-06-01 15:26

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数学与统计学院学术报告[2021] 049

(高水平大学建设系列报告549)

报告题目:  人工智能超级计算精准药物发现:抗衰老与新冠

报告人:魏冬青  教授 上海交通大学

报告时间:202162(400-500 pm)

报告地点:科技楼514                          

报告内容:药物发现是识别具有潜在治疗作用的化合物的过程,其中,预测药物-靶标相互作用(DTI)的步骤必不可少。由于药物同蛋白的互作是多对多的关系,将DTI预测问题融入多标签学习框架中,用新型特征表示方法来提高准确度。开发了基于级联深林(CDF)的模型,DTI 的异构图利用基于路径类别的多相似性特征。同时为了进一步提高预测性能,在多标签分类中引入社区检测方法来预测DTI,命名为DTI-MLCD。把这些最新AI药物发现技术整合到计算机辅助药物设计软件SAMM之中,并构建细胞色素P450酶多态性基因型-表型相关性数据库。把深度学习等非线性方法开发了统计预测模型以及基于web的软件工具并应用到药物构效关系,药物代谢以及毒理和基因表型相关性的研究中。开发了SNPsADMET 在线预测平台, 并将其应用到各种典型体系,对个性化药物用药有一定的指导意义。

报告人简历:魏冬青,男,长聘教授,博士生导师,上海交通大学生命学院及微生物代谢国家重点实验室,Nature-Springer期刊“Interdisciplinary Sciences-Computational Life Sciences”主编(科学院2), 高被引学者。长期从事生物信息学,生物体系的分子模拟,药物代谢与个性化药物, 疾病与生物标志的精准模型,计算机辅助药物设计,蛋白质相互作用与识别, 蛋白机器等领域的研究工作。主持国家重点研究领域项目,自然科学基金重点项目和多项国家自然科学基金面上项目。发表SCI文章400篇,主编专著9部,引用超过10000次,H因子60。中国交叉科学学会副理事长,中国卫生信息学会大数据应用评估与保障专业委员会副主委,中国运筹学会计算系统生物学常务理事。获得横山亮次奖、中华医学二等奖、计算机协会自然科学二等奖,上海市科学技术一等奖和上海市优博导师称号。

                          数学与统计学院

 

                                               20210601