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学术报告一百二十一:单细胞转录谱功能通路挖掘解析癌症的细胞起源

时间:2021-01-07 11:08

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数学与统计学院学术报告[2020] 121

(高水平大学建设系列报告474)

报告题目:单细胞转录谱功能通路挖掘解析癌症的细胞起源

报告人:苏建忠  教授(温州医科 大学

报告时间:20201210日(2:30-3:10 pm

报告地点: 汇星楼514

报告邀请人:邱育珊                           

报告内容:单细胞转录组测序技术可以从单个细胞的水平分析细胞间的异质性,研究肿瘤微环境,寻找癌细胞的起源等,在传统分析流程中对细胞分群进行功能性解释一直是单细胞转录组解析的一大挑战。我们开发对单细胞进行转录组功能通路注释新方法scTPA,提供在通路水平上对单细胞转录组数据预处理,功能通路活性打分,聚类和细胞类型特异的激活通路挖掘及可视化等系统研究。并应用到视网膜母细胞瘤和脑癌中来挖掘癌细胞的起源。

报告人简历:苏建忠博士,教授、博士生导师,温州医科大学生物医学大数据研究所所长,国家高层次引进青年人才,浙江省高校领军人才,浙江省杰出青年基金获得者。主持国家自然科学面上项目、国家自然科学重点基金子课题等多项科研课题。主要从事恶性肿瘤遗传和表观遗传数据挖掘,循环肿瘤DNA甲基化标志物鉴定,单细胞大数据功能注释算法开发,及眼病基因组学等方面的研究工作。开发在线算法工具和数据库10个,发表高水平SCI论文50余篇(累计影响因子400余点)H Index: 24。其中在Nature GeneticsBloodNature CommunicationsGenome Biology, Nucleic Acids ResearchPNAS等国际高水平期刊发表研究论文20余篇。

欢迎感兴趣的师生参加!

 

                          数学与统计学院

 

                                                20201126